Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NOD1Q9Y239 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOD1Q9Y239 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOD1Q9Y239 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOD1Q9Y239 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOD1Q9Y239 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOD1Q9Y239 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NOD1Q9Y239 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOD1Q9Y239 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOD1Q9Y239 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOD1Q9Y239 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms