Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQM7

CAMK2A, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2AQ9UQM7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2AQ9UQM7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1532.2 ms