Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC3Q9UQE7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC3Q9UQE7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC3Q9UQE7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC3Q9UQE7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC3Q9UQE7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC3Q9UQE7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC3Q9UQE7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC3Q9UQE7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC3Q9UQE7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC3Q9UQE7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC3Q9UQE7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMC3Q9UQE7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC3Q9UQE7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC3Q9UQE7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms