Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF18Q9UNG2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms