Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYO6Q9UM54 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO6Q9UM54 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MYO6Q9UM54 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYO6Q9UM54 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYO6Q9UM54 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYO6Q9UM54 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYO6Q9UM54 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYO6Q9UM54 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYO6Q9UM54 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYO6Q9UM54 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYO6Q9UM54 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MYO6Q9UM54 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYO6Q9UM54 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYO6Q9UM54 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYO6Q9UM54 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms