Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HDAC9Q9UKV0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC9Q9UKV0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.4 ms