Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ9

PGAP2, Post-GPI attachment to proteins factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP2Q9UHJ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PGAP2Q9UHJ9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PGAP2Q9UHJ9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PGAP2Q9UHJ9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PGAP2Q9UHJ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PGAP2Q9UHJ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PGAP2Q9UHJ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PGAP2Q9UHJ9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PGAP2Q9UHJ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PGAP2Q9UHJ9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PGAP2Q9UHJ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PGAP2Q9UHJ9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PGAP2Q9UHJ9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PGAP2Q9UHJ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PGAP2Q9UHJ9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PGAP2Q9UHJ9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PGAP2Q9UHJ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PGAP2Q9UHJ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PGAP2Q9UHJ9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PGAP2Q9UHJ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGAP2Q9UHJ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms