Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.17■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC44.17■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC44.15■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC44.13■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
CC2D2AQ9P2K1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
CC2D2AQ9P2K1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC43.97■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.96■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC43.96■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC43.95■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC43.95■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC43.95■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
CC2D2AQ9P2K1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms