Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms