Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP35Q9P2H5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP35Q9P2H5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
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