Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PODXL2Q9NZ53 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PODXL2Q9NZ53 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PODXL2Q9NZ53 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms