Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
CDK12Q9NYV4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CDK12Q9NYV4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CDK12Q9NYV4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms