Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf42Q9NWW7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms