Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF3Q9NUQ8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms