Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL1RAPQ9NPH3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms