Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSU72Q9NP77 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms