Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCL2

GPAM, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAMQ9HCL2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GPAMQ9HCL2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPAMQ9HCL2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPAMQ9HCL2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms