Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAC7

SUGCT, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGCTQ9HAC7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SUGCTQ9HAC7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUGCTQ9HAC7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SUGCTQ9HAC7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms