Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA6CQ9H3T2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms