Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR6

RTN4R, Reticulon-4 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RQ9BZR6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4RQ9BZR6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN4RQ9BZR6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms