Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NIFKQ9BYG3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NIFKQ9BYG3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms