Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC3Q9BY71 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms