Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRA6Q9BX79 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRA6Q9BX79 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms