Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERPUD2Q9BSE4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HERPUD2Q9BSE4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms