Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms