Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT9

GINS4, DNA replication complex GINS protein SLD5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS4Q9BRT9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GINS4Q9BRT9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINS4Q9BRT9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms