Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PYM1Q9BRP8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PYM1Q9BRP8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms