Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF3CQ99613 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms