Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNN2Q99439 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNN2Q99439 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms