Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCLRE1CQ96SD1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms