Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INPP4AQ96PE3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INPP4AQ96PE3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INPP4AQ96PE3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms