Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMDN2Q96LZ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms