Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C12orf42Q96LP6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C12orf42Q96LP6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
C12orf42Q96LP6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms