Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00208Q96KT6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms