Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX27Q96GQ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX27Q96GQ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms