Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC39Q96DD0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms