Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO6Q96DC7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms