Protein–RNA interactions for Protein: Q96D96

HVCN1, Voltage-gated hydrogen channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HVCN1Q96D96 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HVCN1Q96D96 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HVCN1Q96D96 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HVCN1Q96D96 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HVCN1Q96D96 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HVCN1Q96D96 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HVCN1Q96D96 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HVCN1Q96D96 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HVCN1Q96D96 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HVCN1Q96D96 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HVCN1Q96D96 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms