Protein–RNA interactions for Protein: Q96A83

COL26A1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL26A1Q96A83 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL26A1Q96A83 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL26A1Q96A83 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms