Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC47Q96A33 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC47Q96A33 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
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