Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKD1Q969G9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms