Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC9Q92623 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC9Q92623 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms