Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2Q8WWK9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CKAP2Q8WWK9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.9 ms