Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM239Q8WW34 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms