Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJA4Q8WW22 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJA4Q8WW22 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms