Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWIST2Q8WVJ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms