Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C17orf47Q8NEP4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms