Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND61

C3orf20, Uncharacterized protein C3orf20, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf20Q8ND61 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C3orf20Q8ND61 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C3orf20Q8ND61 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms