Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAU1

FNDC5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC5Q8NAU1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC5Q8NAU1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC5Q8NAU1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC5Q8NAU1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC5Q8NAU1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC5Q8NAU1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC5Q8NAU1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC5Q8NAU1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC5Q8NAU1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC5Q8NAU1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC5Q8NAU1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC5Q8NAU1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FNDC5Q8NAU1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC5Q8NAU1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms