Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXK0

PHC2, Polyhomeotic-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC2Q8IXK0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC2Q8IXK0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC2Q8IXK0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC2Q8IXK0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC2Q8IXK0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC2Q8IXK0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC2Q8IXK0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC2Q8IXK0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC2Q8IXK0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC2Q8IXK0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC2Q8IXK0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC2Q8IXK0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PHC2Q8IXK0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHC2Q8IXK0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHC2Q8IXK0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms